Beta-Lactamase DataBase (BLDB): Structure and Function
Beta-Lactamase DataBase
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Beta-Lactamase DataBase

Sequence alignment for the KPC beta-lactamase family

KPC-2
........10........20........30........40........50........60........70........80........90.......100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.......270.......280.......290.......300.......310.......320.......330.......340...
----MSLYRRLVLLSCLSWPLAGFSATALTNLVAEPFAKLEQDFGGSIGVYAMDTGSGATVSYRAEERFPLCSSFKGFLAAAVLARSQQQAGLLDTPIRYGKNALVPWSPISEKYLTTGMTVAELSAAAVQYSDNAAANLLLKELGGPAGLTAFMRSIGDTTFRLDRWELE--LNSAIPGDARDTSSP----------------------------RAVTESLQKLTLGSALAAPQRQQFVDWLKGNTTGNHRIRAAVPADWAVGDKTGTCG-VYGTANDYAVVWPTGRAPIVLA-VYTRAPNKD-------DK-HSE---A---VIAAAARLALEGLGVNGQ
KPC-3 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.66 %
KPC-4 ----......................................................................................................R................................................................--...............----------------------------........................................................-G.....................-.........-------..-...---.---..................  99.32 %
KPC-5 ----......................................................................................................R................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-6 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-G.....................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-7 ----................................................I......................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-8 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-G.....................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-10 ----......................................................................................................R................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-11 ----......................................................................................................L................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-12 ----.......................................................................................................................................................................--M..............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-13 ----..........................................................................................G............................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-14 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................VY--A-.................VYTRAPN---------------KDDKHSEA..................  90.70 %
KPC-15 ----......................................................................................................R...............L..........................K.....................--...............----------------------------........................................................-G.....................-.........-------..-Y..---.---..................  98.29 %
KPC-16 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------..................S....L................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.32 %
KPC-17 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------.......................L................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-18 ----.......I...............................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-19 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---...............T..  99.32 %
KPC-20 ----............................I..........................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-21 ----.......................................................................................................R...............................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-22 ----.......................................................................................................G...............................................................--...............----------------------------.......................L................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.32 %
KPC-23 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-A.....................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-24 ----.....P.................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-25 ----.......................................................................................................................................................................LE...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKHSEA..................  92.05 %
KPC-26 ----.................S.....................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-27 ----.......................................................................................................R...............................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-28 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................VY--A-.................VYTRAPN---------------KDDKYSEA..................  90.70 %
KPC-29 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.------------KDDKYSEA..................  93.00 %
KPC-30 ----.....H.................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-31 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-32 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-...M..................-.........-------..-Y..---.---..................  98.98 %
KPC-33 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-34 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEA-------KDDKHSEA..................  91.48 %
KPC-35 ----.......................................................................................................................................................................--P..............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-36 ----.................................................................................................................................................................E.....--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-37 ----...................................................................................................................................................................R...--...............----------------------------.......................L................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.32 %
KPC-38 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..............A...  99.32 %
KPC-39 ----.......................................................................................................................................................................--...T...........----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-40 ----.......................................................................................................................................................................LE...............----------------------------........................................................-...S..................VYTRAPN---------------KDDKYSEA..................  91.72 %
KPC-41 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKPN------------KDDKYSEA..................  92.67 %
KPC-42 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-.............A........-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-43 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------.......R................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-44 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEAVYTRAPNKDDKHSEA..................  90.58 %
KPC-45 ----...........................................................................................K...........................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-46 ----.......................................................................................................................................................................--P..............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-47 ----.......................................................................................................................................................................--...T...........----------------------------........................................................-...A..................-.........-------..-Y..---.---..................  98.98 %
KPC-48 ----.......................................................................................................................................................................--P..T...........----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  98.98 %
KPC-49 ----..................................................................................................................................................................S....--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-50 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.VEA..................  98.65 %
KPC-51 ----.......................................................................................................................................................................--..........N....----------------------------........................................................-.H....................-.........-------..-N..------A..................  98.30 %
KPC-52 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-......................V.........-------..-...------A..................  98.64 %
KPC-53 ----.......................................................................................................................................................................LE...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKYSEA..................  92.05 %
KPC-54 ----............................................................S..........................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-55 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.N.......-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-56 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---................W.  99.32 %
KPC-57 ----.......................................................................................................................................................................--..........V....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-58 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.-------NRAPNKDDKHSEA..................  92.69 %
KPC-59 ----.......................................................................................D...............................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-60 ----......................................................................................................................T................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-61 ----.......................................................................................................................................................................--..P............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-62 ----.......................................................................................................................................................................--Q..............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-63 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-.S....................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-64 ----.......................................................................................................................................................................--.............---------------------------SSP........................................................-...A..................VHTRAPNKD.KYS---------------EA..................  91.39 %
KPC-65 ----.......................................................................................................................................................................--............--------------------------YTSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KYSE---------------A..................  90.79 %
KPC-66 ----......................................................................................................................................................................----..............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKYSEA..................  92.00 %
KPC-67 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.K------.---DKDDKYSEA..................  93.02 %
KPC-68 ----.......................................................................................................................................................................--............--------------------------SSSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KYSE---------------A..................  90.79 %
KPC-69 ----....................................................................................................................................................................G..LE...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKYSEA..................  91.72 %
KPC-70 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-......................-..A......-------..-Y..---.---..................  98.98 %
KPC-72 ----.......................................................................................................................................................................--...D...........----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-73 ----......................................................................................................................................................................----..............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHS---------KDDKHSEA..................  91.42 %
KPC-74 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------.......................................................---.....................VYTRAP-.--------------KDDKHSEA..................  92.33 %
KPC-75 ----............F..........................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-78 ----.......................................................................................................................................................................--..........A....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-79 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN--------VYTRAPNKDDKHSEA..................  91.75 %
KPC-80 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKPN------------KDDKHSEA..................  92.67 %
KPC-81 ----.......................................................................................................................................................................--...-A..........----------------------------........................................................-......................VYTRA-..--------------KDDKHSEA..................  92.67 %
KPC-82 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSD-------------SEA..................  92.69 %
KPC-83 ----.................................T.....................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-84 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-...P..................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-85 ----.......................................................................................................................................................................--...V...........----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-86 ----.......................................................................................................................................................................--..........G....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-87 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................VY--A..................VYTRAPN---------------KDDKHSEA..................  91.03 %
KPC-88 ----.......................................................................................................................................................................--.......Y.......----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-89 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-...M..................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-90 ----.......................................................................................................................................................................--............--------------------------YTSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSE---------------A..................  90.79 %
KPC-91 ----.....................................................................................................L.................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-92 ----......................................................................................................................................................................----D.............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKYSEA..................  91.67 %
KPC-93 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN----------NRAPNKDDKHSEA..................  92.36 %
KPC-94 ----.......................................................................................................................................................................--H-.............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKYSEA..................  92.00 %
KPC-95 ----.......................................................................................................................................................................--...T......Y....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  98.98 %
KPC-96 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-.N....................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-97 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEAVN----------SEA..................  91.78 %
KPC-98 ----..................................................................................................................................................................H....--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-99 ----..................................................................................................................................................................S....--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-100 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-...M..................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-101 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHKH-------------SEA..................  92.69 %
KPC-102 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-.D....................-.........-------..-...---.---..................  99.32 %
KPC-103 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEAVIA---AKDDKHSEA..................  90.88 %
KPC-104 ----.......................................................................................................................................................................--............--------------------------YTSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSE---------DDKHSEA..................  89.32 %
KPC-105 ----.......................................................................................................................................................................--Q..............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEAVYTRAPNKDDKHSEA..................  90.26 %
KPC-106 ----.......................................................................................................................................................................--............--------------------------YTSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSE--------A---VSEA..................  90.20 %
KPC-107 ----.......................................................................................................................................................................--...............RAVTESLQKLTLGSALAAPQRQQFVSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSE--------A-------..................  85.58 %
KPC-108 ----.......................................................................................................................................................................--...............RAVTE------------------NTSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEAVYTRAPNKDDKHSEA..................  87.74 %
KPC-110 ----.........................................R.............................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  98.98 %
KPC-111 ----.......................................................................................................................................................................--.....L....Y....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  98.98 %
KPC-112 ----......................................................................................................................................................................----..............----------------------------........................................................VY--A-.................VYTRAPN---------------KDDKHSEA..................  90.03 %
KPC-113 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRG.....-------..-...------A..................  97.63 %
KPC-114 ----.......................................................................................................................................................................--............--------------------------SSSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSE---------------A..................  90.79 %
KPC-115 ----......................................................................................................................................................................----EP............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKYSEA..................  91.33 %
KPC-116 ----.......................................................................................................................................................................--..F............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-117 MSRCPIFR.F.................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKHSEA..................  89.80 %
KPC-118 ----.....................................................................................................L.............................................................R...--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  98.98 %
KPC-119 ----.....................................H.................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-120 ----......................................................................................................R................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.32 %
KPC-121 ----.......................................................................................................................................................................--.............---------------------------SSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KYS---------------EA..................  91.72 %
KPC-122 ----.......I...............................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-123 ----.......................................................................................................................................................................--............--------------------------YTSSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSE--------ADDKHSEA..................  89.32 %
KPC-125 ----.......................................................................................................................................................................--..........A....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-126 ----.......................................................................................................................................................................--...V...........----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-127 ----.......................................................................................................................................................................LE...T...........----------------------------........................................................-......................VYTRAPN---------------KDDKHSEA..................  91.72 %
KPC-128 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-...M..................-.........-------..-...---.---..................  99.32 %
KPC-130 ----.......................................................................................................................................................................--..........G....----------------------------........................................................-......................-.........-------..-Y..---.---..................  99.32 %
KPC-131 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------................................A.......................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
KPC-132 ----.......................................................................................................................................................................--...............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.K------SRAPNKDDKYSEA..................  92.38 %
KPC-133 ----.......................................................................................................................................................................--..........G....----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEAVYTRAPNKDDKHSEA..................  90.26 %
KPC-134 ----.......................................................................................................................................................................--..........A....----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.-------NRAPNKDDKHSEA..................  92.36 %
KPC-135 ----......................................................................................................................................................................----..............----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEAVYTRAPNKDDKHSEA..................  89.94 %
KPC-138 ----.......................................................................................................................................................................--P..............----------------------------........................................................-...A..................VYTRAPNKD.KHSEAVN----------SEA..................  91.12 %
KPC-139 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................-......................VYT-......-------..-..KDDKHSEA..................  95.67 %
KPC-140 ----.......................................................................................................................................................................--..........N....----------------------------........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSEAVYTRAPNKDDKHSEA..................  90.26 %
KPC-141 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------........................................................G......................VYTRA-..--------------KDDKHSEA..................  92.69 %
KPC-142 ----.......................................................................................................................................................................--.............---------------------------SSP........................................................-......................VYTRAPNKD.KHSE--------A-VKHSEA..................  90.52 %
KPC-143 ----.......................................................................................................................................................................--..........Y....----------------------------...S....................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.32 %
KPC-144 ----.......................................................................................................................................................................--...T...........----------------------------........................................................-......................-.........-------..-...---.---..................  99.66 %
A-KPC phylogenetic tree

Last updated: November 16, 2022.

If you use BLDB please cite: Naas, T.; Oueslati, S.; Bonnin, R. A.; Dabos, M. L.; Zavala, A.; Dortet, L.; Retailleau, P.; Iorga, B. I., Beta-Lactamase DataBase (BLDB) – Structure and Function. J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 2017, 32, 917-919.

The development of the BLDB database is funded in part by the JPIAMR transnational project DesInMBL, the Région Ile-de-France (DIM Malinf) and the Laboratory of Excellence in Research on Medication and Innovative Therapeutics (LERMIT).

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