Beta-Lactamase DataBase (BLDB): Structure and Function
Beta-Lactamase DataBase
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Beta-Lactamase DataBase

Sequence alignment for the CTX-M beta-lactamase family

CTX-M-1
........10........20........30........40........50........60........70........80........90.......100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.......270.......280.......290.......300.......310...
---MVKKSLRQFT-LMATAT--V-----TLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAVAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVDGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLISHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNL------TLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTNGL-----
CTX-M-2 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  79.73 %
CTX-M-3 ---..........-......--.-----..............................................................A....................................N.........................A.....................................................------............................................................................................D..-----  98.63 %
CTX-M-4 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS........Q...........V...............A.....Q...DKH........RA..............N...T....G.G.......T......A.L...DK......S................S..........T.L......K..------......AET........L......S...R..M.K..G.....................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  76.98 %
CTX-M-5 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H...NS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K..G.....................ANH...V........EQ..........A......H.F-----  80.07 %
CTX-M-6 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................L...............A.....Q...DKH.........A..............N...T....G.G.......T......A.L...DK......S................S..........T.L......K..------......AET........L......S...R....KC.......................ENH...V........EQ..........A......H.F-----  78.35 %
CTX-M-7 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................V...............A.....Q...DKH........RA..............N...T..Q.G.G.......T......A.L...DK......S................S..........T.L......K..------......AET........L......S...R....K..G.....................ENH...V........EQ..........A......H.F-----  77.66 %
CTX-M-8 ---.MRHRVKRMM-..T..C--I-----S.....A.....AN.......A..KS..........D....A.T..................A.....Q..TQKKV.S.K....S...I.....T....N...T..............T......A.L...DK......AI..N.......................T.L.........------...S...ET........L...............T........................EG.............EQ..........A......D.Y-----  80.07 %
CTX-M-9 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..TA....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-10 ---..........-......--.-----.............V..........Q.....................................A....................................N.........................A.....................................................------............................................................................................D..-----  97.94 %
CTX-M-12 ---..........-.....A--.-----..............................................................A...........S........................N.........................A.....................................................------..................................................................................I.........D..-----  97.59 %
CTX-M-13 ---..T.RMQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D.K..T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......EI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-14 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  79.04 %
CTX-M-15 ---..........-......--.-----..............................................................A....................................N.........................A.....................................................------.............................................G..............................................D..-----  98.28 %
CTX-M-16 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..TA.......G............QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.35 %
CTX-M-17 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAK..-----  79.04 %
CTX-M-19 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI...........S..............T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-20 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......F..A......H.F-----  79.73 %
CTX-M-21 ---..T.RVQRMM-FAGG.G--I-----P.....A.F....SAG.....A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.01 %
CTX-M-22 ---..........-......--.-----..............................................................A....................................N.........................A.....................................................------...............................................................................................-----  98.97 %
CTX-M-23 ---..........-......--.-----...................................................................................................N.........................A..........................T..........................------...............................................................................................-----  98.97 %
CTX-M-24 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN..R.........R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-25 ---.MR..V.RAM-..T..C--.-----S...A....C..AN.......A..KS...............T.T........................Q..TQKG..S......P...I..........N...TFG............T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....A....------...N....T......M.L...............T...........G............EG....V.......SE...........A..R...D.Y-----  80.76 %
CTX-M-26 ---.MR..V.RAM-..T..C--.-----S...A....C..AN.......A..KS...............T.T..................A.....Q..TQKG..S......P...I..........N...TFG............T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....A....------...N....T......M.L..........R....T........................EG....V.......SE...........A..R...D.Y-----  80.41 %
CTX-M-27 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T........G............QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-28 ---..........-......--.-----..............................................................A....................................N.........................A.....................................................------.............................................G.................................................-----  98.63 %
CTX-M-29 ---..........-.....A--.-----..............................................................A..............................................................A.....................................................------.............................................G.................................................-----  98.63 %
CTX-M-30 ---..........-.....A--.-----..............................................................A..............................................................A.....................................................------............................................................................................D..-----  98.63 %
CTX-M-31 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S....S......................T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  79.38 %
CTX-M-32 ---..........-......--.-----...................................................................................................................................................................................------.............................................G.................................................-----  99.66 %
CTX-M-33 ---..........-......--.-----..............................................................A............................S.......N.........................A.....................................................------.............................................G..............................................D..-----  97.94 %
CTX-M-34 ---..........-......--.-----.............V..........Q.....................................A....................................N.........................A.....................................................------............................................C...............................................D..-----  97.59 %
CTX-M-35 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S............S..............T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  79.38 %
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CTX-M-37 ---..........-......--.-----.........H..............Q.....................................A..............................................................A.....................................................------............................................................................................D..-----  98.28 %
CTX-M-38 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L........R.R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-39 ---.MR..V.RAM-..T..C--.-----S...A....C..AN.......A..KS...............T.T..................A.....Q..TQKG..S......P...I..........N...TFG............T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....A....------...N....T......M.L...............T........................EG....V.......SE...........A..R...D.Y-----  80.76 %
CTX-M-40 ----MRHRVKRMM-..T..C--I-----S.....A.....AN.......A..KS..........D....A.T..................A.....Q..TQK.V.S.K....S...I..........N...T..............T......A.L...DK......AI..D.......................T.L.......H.------...S...ET........L...............T........................EG.............EQ..........A......D.Y-----  80.07 %
CTX-M-41 ---.MR..V.RAM-..T..C--.-----S...A....C..AN.......A..KS...............T.T..................A.....Q..TQKG..S......P..............N...TFG..I.........T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....A....------...N....T......M.L...............T...........G............EG....V.......SE...........A..R...D.Y-----  80.41 %
CTX-M-42 ---..........-......--.-----..............................................................A....................................N.........................A..........................T..........................------............................................................................................D..-----  98.28 %
CTX-M-43 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K...........G............ENH...V........EQ...R...I..A......H.F-----  79.04 %
CTX-M-44 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ...R...I..A......H.F-----  79.38 %
CTX-M-45 ---..T.RVQRMM-SA.A.C--I-----P.....PT.....SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................TA..G.DVASLRWVMRWAKPSG.V..V--------AQRQYDR..G.R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  68.69 %
CTX-M-46 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......NA......A..KS.......P..D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-47 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..R.......D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-48 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......NA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  79.04 %
CTX-M-49 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..R....P..D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.35 %
CTX-M-50 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS.......P..D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-51 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P...............Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..TA....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  79.04 %
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CTX-M-53 ---..........-......--.-----.............V..........Q..........................................................................N.........................A.....................................................------.............................................G.....................I........................D..-----  97.59 %
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CTX-M-59 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKL........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  79.73 %
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CTX-M-63 ----MRHRVKRMM-..T..C--I-----S.....A.....AN.......A..KS..........D....A.T..................A.....Q..TQK.V.S.K....S...I..........N...T..............T......A.L...DK......AI..D.......................T.L.......H.------...S...ET........L...............T........................EG.............EQ...N......A......D.Y-----  79.73 %
CTX-M-64 ---..........-......--.-----....................................................P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R................G..............................................D..-----  90.03 %
CTX-M-65 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P...............Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN..R.........R.IAE..-----  79.04 %
CTX-M-66 ---..........-......--.-----.....N........................................................A....................................N.........................A.....................................................------............................................................................................D..-----  98.28 %
CTX-M-67 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.....S.......N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-68 ---..........-......--.-----.........H...V................................................A....................................N.........................A.................D...................................------............................................................................................D..-----  97.59 %
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CTX-M-70 ---..........-......--.-----...................................................................................................................................................................................------.............................................G..............................................D..-----  99.31 %
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CTX-M-72 ---..........-......--.-----..............................................................A....................................N.........................A.......................G.............................------............................................................................................D..-----  98.28 %
CTX-M-73 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SAM.....A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-74 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S............T..............T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  79.38 %
CTX-M-75 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----S..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  79.73 %
CTX-M-76 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H...NS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K..G.....................ENH...V........EQ..........A......H.F-----  80.07 %
CTX-M-77 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H...NS...Q.KA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S........K....................I...ENH...V........EQ..........A......R.F-----  80.41 %
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CTX-M-80 ---..........-......--.-----.............V................................................A....................................N.........................A.....................................................------............................................................................................D..-----  98.28 %
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CTX-M-83 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....THV...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
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CTX-M-85 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...TP.............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-86 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.......F.....N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.69 %
CTX-M-87 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P...............Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI...........L..............T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  79.04 %
CTX-M-88 ---..........-......--.-----..............................................................A....................................N.........................A.....................................................------.............................................G..................................H...........D..-----  97.94 %
CTX-M-89 ---.MR..V.RAM-..T..C--.-----S...A....C..AN.......A..KS...............T.T........................Q..TQKG..S......P...I..........N...TFG............T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....A....------...N....T......M.L...............T........................EG....V.......SE...........A..R...D.Y-----  81.10 %
CTX-M-90 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P...............Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI..........................T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T.....................QG....V.........QN............R.IAE..-----  79.38 %
CTX-M-91 ---.MR..V.RAM-..T..C--.-----S...A....C..AN.......A..KS...............T.T........................Q..TQKG..S......P...I..........N...TFG............T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....S....------...N....T......M.L...............T........................EG....V.......SE...........A..R...D.Y-----  81.10 %
CTX-M-92 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET..T.....L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  79.38 %
CTX-M-93 ---..T.RVQRMM-FA.A.C--I-----P.....A......SA......A..KS..........D....T.V...G....P.........A.....Q..TQKQ....P....PA.............N...T..............T......AQL...GG......AI.............Q............T.........Q.------...H...ET........L..........R....T..T........G............QG....V.........QN............R.IAE..-----  78.35 %
CTX-M-94 ---.MR..V.RAM-..T..C--.-----S...A....C..AN.......A..KS...............T.T..................A.....Q..TQKG..S......P...I..........N...T.G............T......A.L...DK......TI..D.......................T.L....A....------...N....T......M.L...............T...........G............EG....V.......SE...........A..R...D.Y-----  80.76 %
CTX-M-95 ---.MTQ.I.RSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H...NS...Q.EA..KS....................................A..L..Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S........K........................ENH...V........EQ..........A......H.F-----  80.41 %
CTX-M-96 ---..........-.....A--.-----..............................................................A...........S........................N.........................A.....................................................------.............................................G....................................I.........D..-----  97.25 %
CTX-M-97 ---.MTQ.IGRSM-.TVM..--L-----P..FS.AT.H..ANS...Q.EA..KS....................................A.....Q...DKH........................N...T....G.........T......A.L...DK......S...........................T.L......K..------......AET........L......S...R....K........................ENH...V........EQ.......I..A......H.F-----  79.38 %
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A-CTX-M phylogenetic tree

Last updated: January 22, 2025.

If you use BLDB please cite: Naas, T.; Oueslati, S.; Bonnin, R. A.; Dabos, M. L.; Zavala, A.; Dortet, L.; Retailleau, P.; Iorga, B. I., Beta-Lactamase DataBase (BLDB) – Structure and Function. J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 2017, 32, 917-919.

The development of the BLDB database was funded in part by the JPIAMR transnational project DesInMBL, the Région Ile-de-France (DIM Malinf) and the Laboratory of Excellence in Research on Medication and Innovative Therapeutics (LERMIT).

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